La bibliothèque Clementinum, un bel exemple de l’architecture baroque, a été ouverte en 1722 pour une université jésuite et possède plus de 20 000 livres. C’est une des plus belles et majestueuses bibliothèques du monde.
Les fresques du plafond ont été peintes par Jan Hiebl. En 1781, le directeur Karel Rafael Ungar met en place Biblioteca Nationalis, une collection de littérature en langue tchèque. Certains des rares livres historiques de cette collection ont été envoyés à Google pour leurs numérisations et seront éventuellement disponibles sur Google Books.
